儿童急性呼吸道感染是常见疾病，分为上呼吸道感染和下呼吸道感染。


急性上呼吸道感染：以急性鼻咽炎为主要表现的普通感冒、急性鼻窦炎、扁桃体炎、喉炎、咽炎、会厌炎等。


急性下呼吸道感染：急性气管支气管炎、细支气管炎、肺炎，其中肺炎是5 岁以下儿童死亡的最主要原因。

常见病原体： 病毒、细菌、肺炎支原体、肺炎衣原体等。

样本类型：
上呼吸道标本：口咽拭子、鼻咽拭子（NPS）、鼻咽吸取物（NPA）


下呼吸道标本：痰液、气管吸取物、支气管肺泡灌洗液等



采集前准备：


收集器和容器

需经过压力蒸汽法等物理灭菌、不含有核酸酶、预装有防核酸降解功能的保存液等


病毒运输液：

除分子诊断外，易干燥的病毒样本（鼻咽拭子）必须采用病毒运输液或其他相应的缓冲液保存样本，以维持病毒颗粒的效价和病毒抗原的稳定。


采集部位：

多数呼吸道病毒的主要感染复制部位为后鼻咽部纤毛柱状上皮细胞，其次为前鼻孔和口咽部纤毛上皮细胞，因此，鼻咽拭子的病原检出率较口咽拭子高。


采样拭子材质：

植绒拭子可吸附更多的生物样本并可达到较高的释放率。植绒材料应该为聚酯纤维或聚酰胺纤维，均不应含藻酸钙，尼龙纤维制成的植绒拭子能收集到更多的呼吸道上皮细胞。


聚氨酯纤维相比尼龙和涤纶拭子更适合用于采集过程中较易出血的患儿。


普通木柄的棉拭子可能含有对细胞培养有害的物质，且常不能采集到足够量的脱落细胞，不适用于鼻咽或口咽部分泌物的采集。